More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3825 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0898  aldehyde dehydrogenase  74.58 
 
 		 565 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 		 481 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  67.22 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  63.64 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  61.72 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  67.44 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0959  aldehyde dehydrogenase  67.23 
 
 		 487 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1720  Aldehyde Dehydrogenase  65.97 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1360  Aldehyde Dehydrogenase  62.63 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3628  Aldehyde Dehydrogenase  63.16 
 
 		 474 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 		 475 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  42.56 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  46.28 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3675  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.622193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  41.4 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3297  putative dehydrogenase  42.95 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1249  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 478 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 475 aa  363  4e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  40.96 
 
 		 464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  39.03 
 
 		 477 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  42.76 
 
 		 475 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  41.5 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  41.5 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 484 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 		 484 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  41.28 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  41.06 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  41.06 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  41.28 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  41.28 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  41.28 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  41.06 
 
 		 474 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  46.2 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  39.15 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  38.27 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  44.64 
 
 		 479 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  41 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 470 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  38.31 
 
 		 469 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 476 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 476 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  39.09 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  32.9 
 
 		 465 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3359  aldehyde dehydrogenase family protein  36.72 
 
 		 475 aa  279  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  38.24 
 
 		 466 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4973  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 484 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000556305  normal  0.433203 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5295  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 484 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000061233  decreased coverage  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  32.47 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3072  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000976863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1097  aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4656  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5184  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000798563  normal  0.630733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3677  Aldehyde Dehydrogenase  37.87 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  37.37 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2189  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.85 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>