More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4656 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1763  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  84.89 
 
 		 484 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217029  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5071  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  82.64 
 
 		 485 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000287939  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0860  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  84.89 
 
 		 484 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000898761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0901  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  84.89 
 
 		 484 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000741631  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2217  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  84.89 
 
 		 484 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000151609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  68.15 
 
 		 484 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  74.89 
 
 		 487 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5877  aldehyde dehydrogenase  66.31 
 
 		 480 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0589  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  84.68 
 
 		 484 aa  836    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000137981  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1905  aldehyde dehydrogenase family protein  84.89 
 
 		 484 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000342687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  68.22 
 
 		 484 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  95.04 
 
 		 484 aa  947    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  68.79 
 
 		 484 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.02 
 
 		 484 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4973  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  93.6 
 
 		 484 aa  936    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000556305  normal  0.433203 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2049  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  84.27 
 
 		 484 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000445966  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.93 
 
 		 485 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  65.03 
 
 		 488 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  65.36 
 
 		 486 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.94 
 
 		 484 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  83.68 
 
 		 483 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4795  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  83.47 
 
 		 483 aa  814    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000133689  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.38 
 
 		 484 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5295  aldehyde dehydrogenase  93.39 
 
 		 484 aa  933    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000061233  decreased coverage  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5184  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  99.17 
 
 		 484 aa  980    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000798563  normal  0.630733 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0492  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  84.89 
 
 		 484 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6228  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  82.64 
 
 		 485 aa  819    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 		 484 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3072  aldehyde dehydrogenase  93.37 
 
 		 483 aa  930    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000976863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3428  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  93.8 
 
 		 484 aa  912    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000575813  normal  0.0325207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  67.02 
 
 		 484 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4656  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 484 aa  987    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  67.38 
 
 		 484 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1097  aldehyde dehydrogenase  65.12 
 
 		 490 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0815  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.38 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2170  aldehyde dehydrogenase family protein  59.38 
 
 		 517 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.212122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0907  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.38 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140416  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4876  aldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 		 485 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603183  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3677  Aldehyde Dehydrogenase  48.58 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  36.21 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  37.17 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  37.14 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 472 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  39.05 
 
 		 472 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  35.91 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  36.92 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  36.46 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  35.41 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 480 aa  290  6e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 		 494 aa  285  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 		 470 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.19 
 
 		 484 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 		 476 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  34.88 
 
 		 469 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 		 490 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  34.07 
 
 		 474 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.19 
 
 		 486 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  38.48 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  33.77 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  34.73 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  33.84 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  34.07 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  34.73 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  34.07 
 
 		 474 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  34.73 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  34.73 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  34.73 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 		 464 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  34.51 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  33.68 
 
 		 475 aa  273  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  37.07 
 
 		 476 aa  272  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  34.51 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  34.06 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  34.34 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  35.76 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.46 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.46 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  34.43 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.75 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.98 
 
 		 489 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.76 
 
 		 482 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.14 
 
 		 496 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.92 
 
 		 491 aa  269  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 481 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  36.06 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  35.1 
 
 		 473 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  35.17 
 
 		 478 aa  266  5e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 		 489 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.77 
 
 		 489 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 		 477 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>