More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0227 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  68.91 
 
 		 477 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  69.96 
 
 		 477 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  68.91 
 
 		 477 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  69.83 
 
 		 478 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 		 477 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  973    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  69.75 
 
 		 477 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  68.91 
 
 		 477 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  75.21 
 
 		 475 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  69.96 
 
 		 477 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 		 477 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  69.07 
 
 		 475 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 		 477 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  69.96 
 
 		 477 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1249  Aldehyde Dehydrogenase  70.04 
 
 		 478 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  73.95 
 
 		 478 aa  695    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 		 477 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3297  putative dehydrogenase  69.41 
 
 		 478 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  75.21 
 
 		 477 aa  712    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  69.96 
 
 		 477 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  70.76 
 
 		 476 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  70.8 
 
 		 477 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3675  aldehyde dehydrogenase  70.59 
 
 		 477 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.622193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  69.96 
 
 		 477 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  52.74 
 
 		 475 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  49.68 
 
 		 494 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  48.5 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  48.28 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  46.17 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  42.68 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  42.89 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  42.89 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  42.89 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  42.68 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  42.68 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  42.89 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  42.04 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  41.67 
 
 		 475 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  41.83 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  43.14 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  47.15 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.92 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  43.75 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  45.96 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3628  Aldehyde Dehydrogenase  47.44 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0959  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1720  Aldehyde Dehydrogenase  47.13 
 
 		 477 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  41.38 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  43.43 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  40.81 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  40.26 
 
 		 464 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  38.51 
 
 		 484 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  39.36 
 
 		 472 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1360  Aldehyde Dehydrogenase  46.24 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0898  aldehyde dehydrogenase  44.78 
 
 		 565 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120021 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 465 aa  339  8e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  39.21 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 476 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  38.65 
 
 		 491 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  43.18 
 
 		 479 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  35.87 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  37.17 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  38.09 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  38.19 
 
 		 473 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 		 480 aa  299  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  37.85 
 
 		 484 aa  296  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  36.92 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  37.17 
 
 		 483 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5295  aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000061233  decreased coverage  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3072  aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000976863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4973  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000556305  normal  0.433203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 480 aa  286  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4656  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 		 484 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  36.84 
 
 		 487 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5184  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  36.2 
 
 		 484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000798563  normal  0.630733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5071  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  35.82 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000287939  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  37.56 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6228  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  35.47 
 
 		 485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4795  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000133689  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>