58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1973 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  97.82 
 
 
229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  38.22 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  37.31 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  36.12 
 
 
234 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  41.2 
 
 
234 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  32.62 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  34.78 
 
 
228 aa  128  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  32.47 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  32.47 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  38.34 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  36.23 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  31.6 
 
 
235 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  33.63 
 
 
234 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  32.99 
 
 
240 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  31.17 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  31.7 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  34.38 
 
 
234 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  31.44 
 
 
231 aa  121  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  31.09 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  28.18 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  32.17 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  34.06 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  37.95 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  27.95 
 
 
230 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  33.54 
 
 
265 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  27.95 
 
 
230 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  29.06 
 
 
251 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  29.24 
 
 
231 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  28.38 
 
 
231 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  30.53 
 
 
235 aa  101  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  33.85 
 
 
233 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  28.26 
 
 
231 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  31.47 
 
 
229 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  34.38 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  29.52 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  29.1 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  29.69 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  29.65 
 
 
221 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  30.9 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  30.9 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  24.88 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  27.51 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  24.28 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  25.41 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  25.15 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  25.56 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  30.39 
 
 
283 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>