55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1689 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1689  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1423  precorrin-2 dehydrogenase  94.71 
 
 		 220 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.747148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1196  precorrin-2 dehydrogenase  32.58 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  29.79 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  29.08 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  25.63 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  26.15 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  29.69 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  29.69 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  23.81 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  25.93 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.32 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.91 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  29.79 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  27.41 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  25.96 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  28.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  25.36 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  26.12 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  26.12 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  27.22 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  25.41 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  28.91 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.73 
 
 		 626 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  24.29 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  22.22 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  31.68 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  24.24 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.26 
 
 		 482 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  23.35 
 
 		 313 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  23.88 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  23.61 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  25 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  25 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.92 
 
 		 502 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  25 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  25.35 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  23.48 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  26.77 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  23.28 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.11 
 
 		 487 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  23.7 
 
 		 457 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  23.15 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  21.65 
 
 		 457 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  26.74 
 
 		 326 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  23.66 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.62 
 
 		 398 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.62 
 
 		 398 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.62 
 
 		 398 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  26.42 
 
 		 306 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  25 
 
 		 224 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>