34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1396 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1396  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000166179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1208  hypothetical protein  89.33 
 
 		 300 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000509296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0242  hypothetical protein  37.29 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00206072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2276  hypothetical protein  33.22 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000101382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2382  hypothetical protein  31.13 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2230  hypothetical protein  29.57 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0540  hypothetical protein  29.53 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0998  hypothetical protein  27.1 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.930376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2131  hypothetical protein  29.1 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2650  hypothetical protein  27.63 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1597  hypothetical protein  28.62 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1841  hypothetical protein  26.19 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0421  CopG family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0923305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3304  hypothetical protein  27 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.179298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2742  hypothetical protein  29.28 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00120775  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0560  hypothetical protein  26.12 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.15423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2174  hypothetical protein  26.07 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.78837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2692  hypothetical protein  26.17 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.45501e-19 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0067  Uncharacterized conserved protein UCP018688  29.39 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.324653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1046  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.899913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3004  hypothetical protein  26.25 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.073246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0694  hypothetical protein  25.99 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.135494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1524  hypothetical protein  25.91 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0476876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2109  hypothetical protein  23.75 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1020  hypothetical protein  24.58 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0720  hypothetical protein  24.75 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0895  hypothetical protein  25.34 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1202  hypothetical protein  27.41 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.242848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0188  hypothetical protein  27.03 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0117  hypothetical protein  25.91 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.256011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0405  ribonuclease HII (RNase HII)  25.93 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2675  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000384013  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0712  hypothetical protein  23.18 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1574  hypothetical protein  20.9 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.95282e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>