51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0250 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  755    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  54.07 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  43.9 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  36.27 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  36.29 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  40.66 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  38.53 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  37.72 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  35.58 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  40.85 
 
 		 357 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  36.27 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  37.76 
 
 		 361 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  37.24 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  35.6 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  36.97 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  39.4 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  39.33 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  39.33 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  36.34 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  39.33 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  38.25 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  36.41 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  36.07 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  35.15 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  35.75 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  44.75 
 
 		 245 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  34.3 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  35.82 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  33.43 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  31.28 
 
 		 351 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  34.6 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  32.78 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  36 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  36.73 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  35.61 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  48.05 
 
 		 85 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  27.41 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  26.53 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  32.41 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  29.63 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  29.7 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  30.1 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  29.63 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  28.7 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  28.7 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  28.7 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  28.7 
 
 		 315 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  27.97 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  27.64 
 
 		 315 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  27.47 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  28.23 
 
 		 995 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>