33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02580 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM02580  conserved hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  943    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346207  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02690  conserved hypothetical protein  56.96 
 
 
475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03460  conserved hypothetical protein  48.07 
 
 
447 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  26.22 
 
 
324 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
324 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 
324 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
1080 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
1079 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
316 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  23.5 
 
 
353 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 
344 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 
374 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 
719 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
712 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  29.91 
 
 
722 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 
367 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.52 
 
 
346 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  20.95 
 
 
398 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  21.82 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 
344 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  26.56 
 
 
713 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  21.48 
 
 
337 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
311 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  20.39 
 
 
357 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>