236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00360 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00360  aspartate transaminase, putative  100 
 
 
413 aa  853    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0699842  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00950  Aspartate aminotransferase, mitochondrial precursor, putative  73.07 
 
 
453 aa  634    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01993  aspartate transaminase, mitochondrial (Eurofung)  58.99 
 
 
429 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.303718 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23871  aspartate aminotransferase  52.01 
 
 
426 aa  425  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31597  predicted protein  50.38 
 
 
399 aa  420  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.955549  normal  0.45996 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06048  aspartate transaminase (Eurofung)  50 
 
 
445 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.175084  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23059  aspartate transaminase  49.25 
 
 
435 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66059  aspartate aminotransferase  44.96 
 
 
415 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80440  aspartate aminotransferase  42.44 
 
 
439 aa  349  5e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  43.14 
 
 
402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  41.01 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  43.86 
 
 
396 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  42.54 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  42.57 
 
 
400 aa  328  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  43.34 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  41.85 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 
398 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  41.85 
 
 
401 aa  326  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  42.53 
 
 
398 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  41.85 
 
 
398 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08709  aspartate transaminase, cytoplasmic (Eurofung)  40.64 
 
 
416 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  42.3 
 
 
399 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  42.39 
 
 
396 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  42.28 
 
 
398 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  42.56 
 
 
396 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  42.61 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  41.6 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  41.6 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  41.54 
 
 
396 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  41.54 
 
 
396 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  41.46 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  42.2 
 
 
397 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  41.43 
 
 
397 aa  319  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  41.54 
 
 
396 aa  319  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  41.85 
 
 
398 aa  319  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
398 aa  318  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  40.85 
 
 
398 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  41.03 
 
 
398 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  43.08 
 
 
411 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  42.17 
 
 
398 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  40.36 
 
 
398 aa  318  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
397 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  41.6 
 
 
398 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
396 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
396 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
396 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
396 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  42.17 
 
 
398 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  42.05 
 
 
396 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  41 
 
 
399 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  41.1 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  41.92 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  39.9 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  41.44 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  40.45 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  40.3 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  41.27 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  42.31 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
398 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  40.82 
 
 
397 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  41.13 
 
 
398 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  41.07 
 
 
398 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
401 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  41 
 
 
399 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  40.5 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  42.01 
 
 
399 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  40.85 
 
 
398 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
398 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  40.92 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  40.69 
 
 
401 aa  308  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  42.46 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  40.77 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  38.89 
 
 
401 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  40.85 
 
 
398 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
398 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  37.78 
 
 
405 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  40.51 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>