More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1018 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  86.4 
 
 		 398 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  87.91 
 
 		 398 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  94.21 
 
 		 398 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  87.91 
 
 		 398 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  77.33 
 
 		 399 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  79.35 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  77.58 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  71.97 
 
 		 402 aa  597  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  75.31 
 
 		 398 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  76.8 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  75.57 
 
 		 398 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  74.31 
 
 		 398 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  78.35 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  78.35 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  77.32 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  77.58 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  77.58 
 
 		 399 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  77.58 
 
 		 399 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  75.57 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  75.82 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  74.31 
 
 		 398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  72.54 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  73.55 
 
 		 398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  71.54 
 
 		 398 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  68.77 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  71.97 
 
 		 402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  68.77 
 
 		 399 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  67.51 
 
 		 398 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  71.79 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  71.79 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  66.5 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  65.74 
 
 		 398 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  65.49 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  66.25 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  66.25 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  71.79 
 
 		 398 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  65.49 
 
 		 398 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  65.49 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  65.49 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  67.01 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  70.28 
 
 		 398 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  62.31 
 
 		 400 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  62.56 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  63.73 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  56.89 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  56.89 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  56.06 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  53.42 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  55.19 
 
 		 398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  57.83 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  54.29 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  52.66 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  53.42 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  52.91 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  52.9 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  53.54 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  53.65 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  52.15 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  52.9 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  52.9 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  53.02 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  52.15 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  53.02 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  52.39 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  52.76 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  52.51 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  52.51 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  52.51 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  51.64 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  52.14 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  51.89 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  52.01 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  50.89 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  50.89 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  50.63 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>