262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3600 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
407 aa  825    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  54.89 
 
 
402 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  59.19 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
398 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
398 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  57.83 
 
 
398 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  53.65 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  54.41 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  56.39 
 
 
402 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  53.4 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  53.65 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  53.4 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  56.22 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  55.92 
 
 
398 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  56.59 
 
 
399 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  56.42 
 
 
398 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  55.42 
 
 
398 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  56.28 
 
 
399 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  53.65 
 
 
401 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 
399 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  57.62 
 
 
399 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  57.62 
 
 
399 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
398 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  55.42 
 
 
398 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 
399 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  54.66 
 
 
398 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  53.13 
 
 
400 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  54.16 
 
 
399 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  53.9 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  54.66 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  54.66 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
400 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  53.15 
 
 
398 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  54.27 
 
 
398 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  54.41 
 
 
398 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  54.41 
 
 
398 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  53.15 
 
 
398 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  51.14 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  50.75 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
405 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  48.36 
 
 
398 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
399 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  48.36 
 
 
398 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 
401 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  48.11 
 
 
398 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 
400 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  47.22 
 
 
400 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
397 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  47.85 
 
 
399 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
397 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
397 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  46.97 
 
 
400 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  47.73 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
400 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  48.61 
 
 
398 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  45.2 
 
 
398 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
397 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4643  aromatic amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
397 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319396  normal  0.236394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
400 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
400 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
400 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1321  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 
405 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2076  aromatic amino acid aminotransferase  47.26 
 
 
430 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  47.59 
 
 
397 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  47.1 
 
 
398 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  47.74 
 
 
397 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  47.74 
 
 
397 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3097  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 
405 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  47.72 
 
 
402 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  47.22 
 
 
399 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6526  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506561  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  46.21 
 
 
400 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  46.84 
 
 
399 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  46.97 
 
 
398 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  47.74 
 
 
397 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  47.74 
 
 
397 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  45.84 
 
 
398 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  47.74 
 
 
397 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>