297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2076 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2076  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
430 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  70.2 
 
 
405 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1321  aromatic amino acid aminotransferase  71.17 
 
 
405 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2971  aromatic amino acid aminotransferase  70.92 
 
 
405 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600649  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3097  aromatic amino acid aminotransferase  71.43 
 
 
405 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 
398 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  61.21 
 
 
401 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  59.05 
 
 
399 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 
400 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  60.1 
 
 
400 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  59.65 
 
 
397 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  59.4 
 
 
397 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  59.4 
 
 
397 aa  484  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  59.4 
 
 
397 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  59.6 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  59.4 
 
 
397 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  60.35 
 
 
400 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  59.4 
 
 
397 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  59.85 
 
 
400 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
397 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  62.47 
 
 
397 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
411 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  58.9 
 
 
397 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  61.15 
 
 
398 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  58.4 
 
 
397 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
397 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
397 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  57.86 
 
 
402 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
397 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
397 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  58.08 
 
 
397 aa  471  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  58.19 
 
 
397 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  58.08 
 
 
397 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0735  aromatic amino acid aminotransferase  59.6 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.160604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4643  aromatic amino acid aminotransferase  58.9 
 
 
397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319396  normal  0.236394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  58.59 
 
 
398 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3853  aromatic amino acid aminotransferase  58.94 
 
 
397 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3763  aromatic amino acid aminotransferase  58.94 
 
 
397 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  58.08 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
399 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
398 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  54.41 
 
 
399 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  53.9 
 
 
399 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 
398 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
398 aa  425  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6526  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506561  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
398 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  47.36 
 
 
398 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3088  aromatic amino acid aminotransferase  48.86 
 
 
395 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.117971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
401 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
398 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 
398 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 
402 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  49.61 
 
 
396 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  48.12 
 
 
400 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  46.6 
 
 
398 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  46.5 
 
 
400 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  47.86 
 
 
399 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  47.69 
 
 
401 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  48.62 
 
 
402 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  44.84 
 
 
398 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  45.86 
 
 
400 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  45.86 
 
 
400 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  45.84 
 
 
398 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  45.84 
 
 
398 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
399 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  47.74 
 
 
398 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  45.84 
 
 
398 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  46.1 
 
 
398 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  45.84 
 
 
398 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  47.86 
 
 
398 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
399 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  47.61 
 
 
398 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
398 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  47.74 
 
 
398 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  47.86 
 
 
398 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  48.32 
 
 
399 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  46.72 
 
 
399 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  47.26 
 
 
407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>