More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2249 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  88.22 
 
 
399 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  88.72 
 
 
399 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  97.74 
 
 
399 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  90.73 
 
 
399 aa  700    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
399 aa  808    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  90.23 
 
 
399 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  96.74 
 
 
399 aa  744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  97.74 
 
 
399 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
399 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  97.74 
 
 
399 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  90.98 
 
 
399 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  97.49 
 
 
399 aa  732    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
398 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  78.34 
 
 
398 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  78.14 
 
 
398 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  78.14 
 
 
398 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  76.63 
 
 
398 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  72.11 
 
 
402 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  73.37 
 
 
398 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  72.61 
 
 
398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  73.12 
 
 
398 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  68.34 
 
 
398 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  73.12 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  67.09 
 
 
398 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  72.36 
 
 
398 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  67.59 
 
 
398 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  67.09 
 
 
398 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  71.11 
 
 
398 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  67.09 
 
 
398 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  67.09 
 
 
398 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  66.83 
 
 
398 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  66.83 
 
 
398 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  66.58 
 
 
398 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  68.56 
 
 
396 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  70.6 
 
 
398 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  69.1 
 
 
402 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  66.33 
 
 
399 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  69.6 
 
 
398 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  70.1 
 
 
398 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  70.1 
 
 
398 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  69.85 
 
 
398 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  64.41 
 
 
401 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  63.25 
 
 
400 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  63.07 
 
 
400 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
400 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  56.78 
 
 
400 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  54.77 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  57.54 
 
 
407 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  55.14 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  55.14 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  55.14 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  55.14 
 
 
411 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  55.14 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  55.14 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  54.16 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  55.14 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  55.39 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  52.53 
 
 
399 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  53.88 
 
 
397 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  54.64 
 
 
397 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  53.03 
 
 
400 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  53.63 
 
 
397 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  53.63 
 
 
397 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 
397 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  54.02 
 
 
400 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  53.38 
 
 
397 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  51.62 
 
 
401 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
400 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  52.27 
 
 
397 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 
397 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  53.77 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4643  aromatic amino acid aminotransferase  53.38 
 
 
397 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319396  normal  0.236394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
397 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  52.64 
 
 
397 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
397 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
400 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  53.28 
 
 
398 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
397 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  53.13 
 
 
397 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
399 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  51.89 
 
 
397 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  51.74 
 
 
398 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
402 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
399 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>