27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00160 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  100 
 
 
534 aa  1105    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  40.44 
 
 
490 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  38.91 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  47.55 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  47.73 
 
 
317 aa  286  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  48.64 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  40 
 
 
338 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  37.77 
 
 
303 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  36.41 
 
 
419 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  36.55 
 
 
467 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  28.57 
 
 
331 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8598  predicted protein  56.25 
 
 
64 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  23.81 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_17135  predicted protein  25.12 
 
 
234 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  25.77 
 
 
301 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  26.95 
 
 
307 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_19145  predicted protein  30.84 
 
 
322 aa  60.8  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32087  predicted protein  25.32 
 
 
297 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930891  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  30.84 
 
 
319 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29283  predicted protein  23.04 
 
 
222 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  24.31 
 
 
349 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  25.16 
 
 
330 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  25 
 
 
320 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50251  predicted protein  23.42 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49373  predicted protein  26.61 
 
 
362 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483156  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43757  cyc-like protein  23.59 
 
 
491 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>