13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1006 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1006  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  270  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1068  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.883199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3461  major facilitator transporter  32.5 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3285  major facilitator transporter  31.67 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0662  major facilitator transporter  31.67 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0524  major facilitator family transporter  31.67 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  33.05 
 
 
398 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3168  major facilitator transporter  32.26 
 
 
390 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  26.42 
 
 
448 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  32.61 
 
 
482 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  26.42 
 
 
448 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  26.42 
 
 
448 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
446 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>