43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0657 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  80 
 
 
347 aa  364  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  44.55 
 
 
365 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  48.1 
 
 
362 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  46.08 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  44.75 
 
 
380 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  47.06 
 
 
363 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  45.59 
 
 
357 aa  188  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  48.94 
 
 
382 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  46.5 
 
 
364 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  43.14 
 
 
374 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  41.67 
 
 
426 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  42.13 
 
 
356 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  41.05 
 
 
353 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  42.41 
 
 
378 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  40.99 
 
 
356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  40.99 
 
 
356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  40.99 
 
 
356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  40.57 
 
 
361 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  41.41 
 
 
357 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  41.43 
 
 
363 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  42.16 
 
 
363 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  40.29 
 
 
361 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  41.43 
 
 
354 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  39.39 
 
 
375 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  39.81 
 
 
362 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  41.38 
 
 
355 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  41.38 
 
 
351 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  39.9 
 
 
370 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  37.06 
 
 
395 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  45.11 
 
 
394 aa  135  7.000000000000001e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  30.85 
 
 
387 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  31.77 
 
 
281 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  73.33 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  29.25 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  30.61 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  34.29 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  29.76 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  38.33 
 
 
815 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4557  hypothetical protein  32.2 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  26.37 
 
 
460 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3144  hypothetical protein  29.73 
 
 
461 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.9 
 
 
995 aa  42  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>