More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3122 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3122  chaperone with DnaK; heat shock protein  100 
 
 
164 aa  337  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.268695 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1348  heat shock protein DnaJ domain protein  62.5 
 
 
148 aa  185  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4342  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.66 
 
 
146 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.189562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10153  hypothetical protein  47.55 
 
 
149 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
377 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 
369 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2614  heat shock protein DnaJ domain protein  44.07 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  37.84 
 
 
307 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  38.96 
 
 
373 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
369 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15290  heat shock protein DnaJ domain protein  33.68 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00372655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  44.26 
 
 
316 aa  51.2  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  36.67 
 
 
69 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1420  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  47.46 
 
 
380 aa  50.4  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
388 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
380 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  35.56 
 
 
379 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  39.13 
 
 
519 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  49.12 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  49.12 
 
 
371 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
375 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  49.12 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
386 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 
393 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
379 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  33.75 
 
 
381 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
380 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
379 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  46.55 
 
 
375 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  41.07 
 
 
213 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
389 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  46.55 
 
 
376 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 
375 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
404 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  45.76 
 
 
382 aa  48.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  36.11 
 
 
741 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
382 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
387 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
377 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  50.88 
 
 
320 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
373 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
382 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
395 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  46.55 
 
 
368 aa  47.8  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
369 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  38.27 
 
 
379 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
383 aa  47.8  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
388 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
386 aa  47.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  31.11 
 
 
254 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36 
 
 
341 aa  47.4  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
355 aa  47.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  31.11 
 
 
254 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
376 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  33.73 
 
 
378 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
376 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
387 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 
376 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.06 
 
 
334 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
376 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
377 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
376 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
396 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
376 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  45.61 
 
 
330 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  30.63 
 
 
351 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
376 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
374 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
379 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  43.86 
 
 
418 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  42.65 
 
 
634 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
376 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
373 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
383 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
380 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 
401 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  42.86 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  30.93 
 
 
381 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  39.19 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
376 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  44.83 
 
 
380 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
374 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  43.86 
 
 
378 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  42.37 
 
 
305 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  47.37 
 
 
376 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
377 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  43.86 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  45.61 
 
 
382 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44959  predicted protein  41.67 
 
 
500 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00935633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 
375 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  47.37 
 
 
376 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  42.86 
 
 
369 aa  45.8  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 
396 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  43.86 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>