18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2928 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1375    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  41.53 
 
 		 786 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5085  hypothetical protein  30.8 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.707137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  31.88 
 
 		 1597 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.13 
 
 		 6678 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.86 
 
 		 306 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  27.19 
 
 		 1708 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1754  hypothetical protein  26.63 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.11822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  34.04 
 
 		 1159 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.26 
 
 		 11716 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  34.48 
 
 		 283 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.68 
 
 		 2503 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.68 
 
 		 3699 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.68 
 
 		 3699 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  28.44 
 
 		 686 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  40.32 
 
 		 924 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2223 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2039  hypothetical protein  29.52 
 
 		 248 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.425102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>