57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2131 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2131  cation-transporting ATPase  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6597  Heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.63 
 
 		 798 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  34.09 
 
 		 852 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  32.18 
 
 		 835 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  34.72 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  32.63 
 
 		 819 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  25.42 
 
 		 726 aa  48.5  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  31.52 
 
 		 817 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 		 821 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  33.33 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 720 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 802 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  31.91 
 
 		 804 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 69 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.56 
 
 		 797 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 938 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  33.33 
 
 		 804 aa  44.7  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 730 aa  44.7  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 		 839 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.03 
 
 		 794 aa  44.3  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 827 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10677  P1B, P type ATPase  27.38 
 
 		 883 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.704376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 885 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  31.51 
 
 		 841 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  29.07 
 
 		 793 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 836 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  32.35 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 739 aa  42.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 737 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  28.42 
 
 		 803 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 841 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  30.95 
 
 		 835 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 798 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  29.67 
 
 		 802 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 847 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  30.53 
 
 		 833 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  32.22 
 
 		 797 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 798 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  29.67 
 
 		 802 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 769 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  28.99 
 
 		 789 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  30.95 
 
 		 790 aa  41.2  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 825 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  31.03 
 
 		 98 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  30.67 
 
 		 737 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 811 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 811 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  32.84 
 
 		 73 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  29.23 
 
 		 79 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 754 aa  40.8  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  27.94 
 
 		 839 aa  40.8  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 		 884 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  26.97 
 
 		 795 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  24.72 
 
 		 1196 aa  40.8  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 		 723 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  27.69 
 
 		 797 aa  40.8  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>