47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2090 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2090  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5793  protein of unknown function DUF218  50.83 
 
 
225 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3988  protein of unknown function DUF218  36.46 
 
 
433 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672563  normal  0.593684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  22.38 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.72 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  27.13 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  27.13 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  26.77 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  26.36 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  32.69 
 
 
189 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.23 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  26.43 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  27.37 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  25.24 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  28.07 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  28.26 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  34.41 
 
 
345 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  25.19 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  25 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  25.96 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  32.63 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  34.41 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  33.33 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  34.41 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  27.78 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  24.24 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  34.29 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.17 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  31.76 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 
393 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  24.66 
 
 
262 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  23.36 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  23.36 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 
336 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  30.5 
 
 
345 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  20.69 
 
 
210 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>