80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0795 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0795  2Fe-2S ferredoxin  100 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694243  normal  0.0128842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  38.16 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  34.94 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.33 
 
 		 677 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  28.75 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 		 530 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  32.26 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  29.76 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 		 592 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  32.53 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  32.53 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2108  hypothetical protein  32 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 		 596 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  28.38 
 
 		 614 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 		 602 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.07 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  33.33 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 		 575 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  29.67 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  29.07 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  29.76 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  28.05 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 		 572 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  31.94 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  34.29 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  34.29 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 		 535 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4052  NADH dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 		 543 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  26.58 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 		 535 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  34.48 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30.43 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  30 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  35.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.71 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  29.33 
 
 		 603 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 		 408 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  31.94 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.29 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  35 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  30.95 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  34.38 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  31.94 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  35 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 		 614 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.86 
 
 		 410 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 105 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  35.38 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  32.18 
 
 		 107 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  26.51 
 
 		 130 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  30.59 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  29.17 
 
 		 623 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31.87 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  27.91 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  31.82 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  27.91 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 		 595 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  28.4 
 
 		 596 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 		 623 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  37.29 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  31.52 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 		 569 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  29.63 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  29.17 
 
 		 626 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.95 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  32.56 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  30.77 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  27.5 
 
 		 134 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  35 
 
 		 107 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>