27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1850 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1850  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1310    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  52.08 
 
 
649 aa  658    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  38.9 
 
 
653 aa  432  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  23.26 
 
 
770 aa  54.7  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
718 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
718 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
718 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.7 
 
 
719 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  22.41 
 
 
740 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.31 
 
 
746 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  24 
 
 
715 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.05 
 
 
740 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7033  hypothetical protein  24.84 
 
 
874 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.52 
 
 
746 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  21.35 
 
 
776 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.12 
 
 
745 aa  47.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.81 
 
 
696 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  23.06 
 
 
717 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.33 
 
 
738 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  22.22 
 
 
717 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  25.36 
 
 
720 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  23.91 
 
 
711 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  21.4 
 
 
790 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  24.26 
 
 
362 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  18.52 
 
 
806 aa  44.3  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.92 
 
 
738 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  23.08 
 
 
749 aa  43.9  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>