More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13283 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13283  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
321 aa  647    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1473  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.98 
 
 
322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.68 
 
 
316 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.14 
 
 
323 aa  323  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.16 
 
 
321 aa  315  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1241  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.78 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0280664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1360  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.4 
 
 
321 aa  297  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0712  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.81 
 
 
320 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.56 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.39 
 
 
326 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.23 
 
 
329 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.42 
 
 
329 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.69 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.23 
 
 
325 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.23 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  38.23 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.9 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.23 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.23 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.92 
 
 
325 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.92 
 
 
325 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.92 
 
 
325 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.92 
 
 
325 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.58 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.53 
 
 
325 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.23 
 
 
325 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.5 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.5 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.35 
 
 
325 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.25 
 
 
341 aa  185  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.24 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.39 
 
 
330 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6582  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.89 
 
 
323 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.24 
 
 
448 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.81 
 
 
610 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.37 
 
 
320 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.87 
 
 
439 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.11 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.24 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.58 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.69 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.75 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.02 
 
 
317 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.6 
 
 
399 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.75 
 
 
328 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.11 
 
 
443 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.97 
 
 
317 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.93 
 
 
447 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.74 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.45 
 
 
338 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.53 
 
 
320 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.13 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.17 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.62 
 
 
447 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.42 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.62 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  32.52 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  32.52 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.68 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.42 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.63 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0461  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  30.91 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.83 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.59 
 
 
325 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.76 
 
 
601 aa  162  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  35 
 
 
318 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.71 
 
 
320 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.52 
 
 
441 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
452 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.74 
 
 
316 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.33 
 
 
442 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.93 
 
 
346 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
325 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.63 
 
 
436 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.47 
 
 
320 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4277  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
342 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.25 
 
 
317 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.11 
 
 
315 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0327  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.73 
 
 
323 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000160988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  35.65 
 
 
321 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.86 
 
 
317 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.8 
 
 
317 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.82 
 
 
346 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.22 
 
 
314 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.91 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.91 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.16 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.67 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.22 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.64 
 
 
313 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.96 
 
 
309 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.74 
 
 
315 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.46 
 
 
308 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.82 
 
 
436 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.38 
 
 
317 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.2 
 
 
308 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1433  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.2 
 
 
327 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.04 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.88 
 
 
443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.56 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>