17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11188 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  38.31 
 
 
1237 aa  881    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  34.3 
 
 
1243 aa  718    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  100 
 
 
1228 aa  2530    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
1263 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
1223 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  28.59 
 
 
1222 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  26 
 
 
1224 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  26.87 
 
 
870 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  27.03 
 
 
855 aa  291  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  26.9 
 
 
844 aa  274  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  26 
 
 
913 aa  260  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  25.74 
 
 
917 aa  247  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  25.75 
 
 
925 aa  226  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  25.06 
 
 
886 aa  206  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  24.12 
 
 
913 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  25.15 
 
 
913 aa  168  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  31.62 
 
 
474 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>