18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05590 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05590  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  657    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.901081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3052  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1680  hypothetical protein  28.24 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1882  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 502 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 786 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  22.27 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 808 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 934 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 860 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.56 
 
 		 795 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.33 
 
 		 883 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.75 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.82 
 
 		 732 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3461  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 154 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.86 
 
 		 1213 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.45 
 
 		 638 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>