More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0599 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  100 
 
 
425 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  62.59 
 
 
427 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  49.76 
 
 
426 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  35.12 
 
 
413 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  38.12 
 
 
414 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  35.62 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  35.62 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  34.1 
 
 
408 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  32.87 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5387  cytochrome P450  34.48 
 
 
418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.659302  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  34.55 
 
 
404 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  32.97 
 
 
418 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  32.97 
 
 
418 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  32.97 
 
 
418 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  34.27 
 
 
405 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  29.64 
 
 
405 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  29.64 
 
 
405 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  29.64 
 
 
405 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  30.12 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0622  cytochrome P450  31.23 
 
 
415 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  30.47 
 
 
387 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  26.91 
 
 
380 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  29.38 
 
 
388 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  31.62 
 
 
395 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  28.82 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  31.54 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  28.97 
 
 
396 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  29.05 
 
 
412 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.88 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  29.11 
 
 
395 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  27.18 
 
 
411 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  27.18 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  31.92 
 
 
418 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  28.38 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  27.68 
 
 
411 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  27.68 
 
 
411 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  27.43 
 
 
411 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  26.94 
 
 
403 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  28.5 
 
 
418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  26.28 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.68 
 
 
420 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  27.68 
 
 
411 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  28.29 
 
 
405 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  27.18 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  29.53 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  32.01 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  27.43 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  29.46 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  33.54 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  27.43 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  29.46 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  29.46 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  30.08 
 
 
399 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  26.68 
 
 
788 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  31.2 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.47 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  29.46 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  29.55 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  25.34 
 
 
411 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  26.91 
 
 
404 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  30.17 
 
 
399 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.03 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  27.98 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  27.32 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  30.49 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  31.34 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  32.82 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  29.78 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  29.64 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  27.09 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  29.89 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  27.82 
 
 
404 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  29.14 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  34.05 
 
 
427 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  34.05 
 
 
427 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  34.05 
 
 
427 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.19 
 
 
404 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.22 
 
 
426 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.13 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.19 
 
 
404 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  30.19 
 
 
404 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  24.04 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  28.72 
 
 
390 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.13 
 
 
412 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  24.45 
 
 
411 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  26.11 
 
 
400 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  27.56 
 
 
404 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  29.6 
 
 
417 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  27.56 
 
 
404 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  33.33 
 
 
413 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  27.56 
 
 
404 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  25.99 
 
 
399 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  31.29 
 
 
405 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  31.29 
 
 
405 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  31.29 
 
 
405 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7766  cytochrome P450  27.54 
 
 
430 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  28.45 
 
 
414 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  30.35 
 
 
404 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  27.87 
 
 
406 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>