40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1989 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  87.21 
 
 		 171 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  66.67 
 
 		 171 aa  208  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  55.42 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  55.21 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  54.49 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  56.33 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  56.33 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  57.72 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  56.56 
 
 		 314 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  55.35 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  57.38 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  56.56 
 
 		 171 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  41.1 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  42.02 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  40.48 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  41.88 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  43.18 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  35.04 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  36.7 
 
 		 106 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  37.63 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  34.29 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  39.64 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  35.58 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  32.38 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  33.03 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  29.47 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  32.05 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  29.65 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  28.48 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  28.86 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  26.32 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  27.63 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  27.63 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  26.97 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  28.09 
 
 		 181 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.43 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  28.42 
 
 		 280 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3388  hypothetical protein  27.78 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  27.66 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>