27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1167 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1167    100 
 
 		 225 bp  446  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  82.45 
 
 		 1539 bp  111  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  81.38 
 
 		 1548 bp  95.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  82.14 
 
 		 1602 bp  95.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  81.44 
 
 		 1389 bp  85.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  92.86 
 
 		 1539 bp  79.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  90.32 
 
 		 1539 bp  75.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    85.71 
 
 		 1556 bp  71.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  86.49 
 
 		 1542 bp  67.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03350    91.84 
 
 		 297 bp  65.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6921    90.57 
 
 		 327 bp  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 1539 bp  60  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 1539 bp  60  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    79.41 
 
 		 2852 bp  60  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 1539 bp  60  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  88.68 
 
 		 1518 bp  58  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  88.68 
 
 		 1518 bp  58  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5987    88.68 
 
 		 90 bp  58  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  78.92 
 
 		 1158 bp  58  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    83.33 
 
 		 1540 bp  56  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5960    85.29 
 
 		 389 bp  56  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 1533 bp  52  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4829    94.12 
 
 		 489 bp  52  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.271386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  83.12 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  83.12 
 
 		 576 bp  50.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  83.12 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  81.93 
 
 		 1647 bp  46.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>