36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5025 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  31.55 
 
 		 178 aa  87.8  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  32.32 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  30.25 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  30.35 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  43.28 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  26.06 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  28.17 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  33.75 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  33.75 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  25.36 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  29.51 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  26.61 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  38.24 
 
 		 91 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  27.87 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  27.87 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  23.44 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  27.17 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  25.56 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  22.76 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  22.76 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  26.09 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  28.23 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  28.23 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  30.99 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  28.12 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  24.44 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2238  hypothetical protein  28.1 
 
 		 128 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000319661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  23.26 
 
 		 127 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>