20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5014 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1244    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5345  hypothetical protein  36.24 
 
 		 375 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5342  hypothetical protein  40.97 
 
 		 252 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0160747  normal  0.725069 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  33.59 
 
 		 313 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  33.14 
 
 		 660 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  32.93 
 
 		 187 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  32.32 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  33.54 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.71 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0968  hypothetical protein  22.51 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 450 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.23 
 
 		 449 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.83 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 658 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  31.69 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  27.81 
 
 		 548 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.98 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  28.57 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1283  hypothetical protein  21.83 
 
 		 269 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>