29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2626 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  65.66 
 
 		 220 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  61.26 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  57.14 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  50.22 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  49.09 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  46.98 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  50.77 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  50.26 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  49.74 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  50.56 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  49.22 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  51.98 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  43.75 
 
 		 256 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  45.28 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  45.12 
 
 		 247 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  46.06 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  39.89 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  34.3 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  35.68 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  35.5 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  32.87 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  31.9 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  36.48 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  33.99 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  31.45 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  34.52 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>