More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6162 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  60.54 
 
 
229 aa  274  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.89 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  58.74 
 
 
234 aa  271  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  57.66 
 
 
229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  55.86 
 
 
226 aa  267  8e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  58.74 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  58.64 
 
 
228 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5179  glutathione S-transferase-like  54.46 
 
 
231 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776734  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  59.09 
 
 
227 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.57 
 
 
226 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.74 
 
 
234 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1831  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.7 
 
 
235 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.35 
 
 
236 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5133  Glutathione S-transferase domain  53.04 
 
 
233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1690  Glutathione S-transferase domain  48.03 
 
 
231 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5156  Glutathione S-transferase domain  51.74 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561496  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  45.24 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  43.67 
 
 
229 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.49 
 
 
232 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  45.1 
 
 
208 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4163  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.29 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  44.55 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  44.74 
 
 
229 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  40.6 
 
 
237 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  44.55 
 
 
215 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  41.2 
 
 
233 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  40.17 
 
 
234 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  42.29 
 
 
230 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  42.65 
 
 
228 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  43.04 
 
 
229 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  43.42 
 
 
230 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  40.43 
 
 
239 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  41.45 
 
 
235 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.98 
 
 
230 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.98 
 
 
230 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 
209 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.3 
 
 
231 aa  168  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  44.09 
 
 
215 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  39.91 
 
 
233 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  38.94 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.63 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  42.17 
 
 
229 aa  164  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  44.12 
 
 
215 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  42.38 
 
 
209 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  42.54 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.61 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.67 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.74 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  40.89 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  43.63 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  43.63 
 
 
215 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  43.63 
 
 
215 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  43.63 
 
 
215 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  41.51 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  41.38 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  39.3 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  39.38 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.35 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  39.91 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 
230 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  38.5 
 
 
230 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.35 
 
 
236 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  42.86 
 
 
230 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 
208 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.13 
 
 
235 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  39.5 
 
 
222 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.61 
 
 
237 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  40.44 
 
 
255 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  39.62 
 
 
213 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  42.72 
 
 
233 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  37.99 
 
 
236 aa  158  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.53 
 
 
231 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  39.57 
 
 
234 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
233 aa  157  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.17 
 
 
242 aa  157  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  40.8 
 
 
222 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  39.62 
 
 
214 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  37.12 
 
 
232 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.95 
 
 
209 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  36.24 
 
 
233 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  40.65 
 
 
233 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.26 
 
 
235 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>