49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5701 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  95.45 
 
 		 110 aa  197  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.08 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  72 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.42 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.17 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  58.25 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  70.15 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  45.95 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  45.95 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  48.68 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  47.3 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.67 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  41.1 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  38.96 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  36.84 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.72 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.72 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  33.33 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  34.57 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  34.57 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  31.76 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  32.53 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.59 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  34.15 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.86 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.81 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.1 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  24.73 
 
 		 121 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.71 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.67 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.67 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.67 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.67 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  32.89 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.68 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1324  H-NS histone family protein  30.14 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392706  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 144 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  30.67 
 
 		 130 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>