More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5541 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5541  putative insertion element transposase  100 
 
 
87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73359  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  45.95 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2404  putative insertion element transposase  40 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0128303  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  45.95 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  44.59 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  44.59 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  44.59 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  38.1 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  38.1 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  38.1 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  38.1 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  38.1 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  38.1 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  37.65 
 
 
438 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  38.1 
 
 
310 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  38.82 
 
 
390 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  38.82 
 
 
334 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  38.82 
 
 
334 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  38.82 
 
 
334 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  38.82 
 
 
373 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  38.82 
 
 
334 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  38.82 
 
 
334 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  38.82 
 
 
334 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  38.03 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  37.65 
 
 
391 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  42.5 
 
 
210 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  42.5 
 
 
223 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  37.65 
 
 
401 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  42.5 
 
 
229 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  42.5 
 
 
229 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7183  putative transposase A-like protein  39.02 
 
 
283 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173089  normal  0.690368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  36.36 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  40.58 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  36.36 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  40.24 
 
 
250 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  36.05 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  35.23 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  36.14 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  37.68 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  33.33 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  34.15 
 
 
290 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36 
 
 
252 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  32.91 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  32.91 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  37.68 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  35.53 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  31.94 
 
 
175 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  31.94 
 
 
272 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  37.33 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  31.94 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  33.33 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  31.94 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  32.47 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  35.37 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  31.94 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1322  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.71 
 
 
285 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  31.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>