39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4135 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  82.09 
 
 		 134 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  71.88 
 
 		 128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  66.92 
 
 		 138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  62.31 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  65.62 
 
 		 127 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  66.14 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  61.79 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  59.38 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  59.68 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  56.92 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  56.45 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  54.48 
 
 		 136 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  57.36 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  52.34 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  52.94 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  56.2 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  48.44 
 
 		 286 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  48.44 
 
 		 286 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  47.66 
 
 		 286 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  29.57 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  28.15 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  29.36 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  28.45 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  27.45 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  27 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  22 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  22 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  24.18 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  25.93 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  31.51 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>