85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6408 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6408  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.24 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.86 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  25.86 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.86 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  25.48 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  24.15 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24.15 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.48 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.95 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  27.99 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.12 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1079  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.47 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.31 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.3 
 
 
293 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.09 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.55 
 
 
293 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  26.36 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  26.35 
 
 
300 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.37 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.76 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.76 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  25.7 
 
 
297 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.03 
 
 
315 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.01 
 
 
299 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  28.03 
 
 
300 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  26.26 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  26.26 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  26.78 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  25.45 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.92 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.96 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.93 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.36 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.7 
 
 
314 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  25.81 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.09 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  23.51 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.08 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  25.9 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  25.94 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.09 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.99 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.65 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.44 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.23 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.97 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  26.2 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  26.2 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.09 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.15 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.63 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  22.68 
 
 
265 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.63 
 
 
270 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.57 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2519  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.41 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  25.83 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  25.83 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.9 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.76 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.37 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.93 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  32.14 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.81 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  25.81 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.85 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.19 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.26 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  26.07 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.58 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  22.93 
 
 
292 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  29.91 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.18 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1309  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.04 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6520  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.04 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912962  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25 
 
 
286 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0855  PhzF family phenazine biosynthesis protein  21 
 
 
300 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.75 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.45 
 
 
287 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.66 
 
 
259 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  24.55 
 
 
266 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>