188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5339 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  100 
 
 		 487 aa  982    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  50 
 
 		 518 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  50 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  48.06 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  48.97 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  49.26 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  37.77 
 
 		 244 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  42.32 
 
 		 250 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  42.42 
 
 		 236 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  41.45 
 
 		 244 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  34.62 
 
 		 234 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  36.91 
 
 		 238 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  35.17 
 
 		 239 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  35.19 
 
 		 238 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  33.47 
 
 		 230 aa  136  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  40.39 
 
 		 244 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  40.39 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  40.39 
 
 		 244 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  40.39 
 
 		 244 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  36.67 
 
 		 241 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  40.39 
 
 		 244 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  33.19 
 
 		 252 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  38.72 
 
 		 301 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  34.33 
 
 		 236 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  34.75 
 
 		 237 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  37.66 
 
 		 242 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  36.69 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  32.34 
 
 		 232 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  35.77 
 
 		 233 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  35.15 
 
 		 238 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  35.89 
 
 		 233 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  34.82 
 
 		 233 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  34.3 
 
 		 240 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  29.79 
 
 		 226 aa  120  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  34.57 
 
 		 238 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  34.2 
 
 		 220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2418  aspartate racemase  35.78 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.790687  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  30.8 
 
 		 233 aa  110  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  32.03 
 
 		 236 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  31.73 
 
 		 233 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  32.52 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  30.3 
 
 		 236 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  27.35 
 
 		 249 aa  93.6  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  32.93 
 
 		 259 aa  93.6  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  31.87 
 
 		 242 aa  92.4  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  33.49 
 
 		 251 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  33.87 
 
 		 254 aa  87  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  29.11 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3404  aspartate racemase  24.26 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.568997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  30.83 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  28.69 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  28.27 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  25 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  28.27 
 
 		 224 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  28.27 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  27.57 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  27.85 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  27.85 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  30.13 
 
 		 246 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  30.67 
 
 		 238 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  27.08 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  30.96 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  26.36 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  25.37 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  24.79 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  24.79 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  24.36 
 
 		 226 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  23.93 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  23.93 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  23.93 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  24.36 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0528  aspartate racemase  30.13 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  24.36 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  32.08 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  24.36 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  23.93 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  25 
 
 		 238 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  28.05 
 
 		 232 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  22.97 
 
 		 231 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0557  aspartate racemase  29.58 
 
 		 234 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0560  aspartate racemase  29 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0477759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  25.73 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  25.59 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  24.76 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0212  putative aspartate racemase protein  24.76 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  27.7 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  25.17 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  29.76 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  25 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  27.34 
 
 		 235 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  27.34 
 
 		 232 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  27.34 
 
 		 235 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  27.34 
 
 		 232 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  32.14 
 
 		 242 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  27.57 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  23.61 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  28.08 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4364  aspartate racemase  27.05 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  24.07 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>