23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5288 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5288  putative lipoprotein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.359881  normal  0.257829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2274  putative lipoprotein  62.35 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333819  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4157  hypothetical protein  61.73 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00920256  normal  0.218782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2472  putative lipoprotein  62.58 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2079  putative lipoprotein  61.94 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1041  putative lipoprotein  50.56 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5544  putative lipoprotein  50 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2973  hypothetical protein  48.55 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0204945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1493  hypothetical protein  48.72 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0771  putative lipoprotein  51.4 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662485  normal  0.208458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0018  putative lipoprotein  52.26 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1836  hypothetical protein  46.06 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  hitchhiker  0.00066026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1966  putative lipoprotein  43.67 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.361351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24500  putative lipoprotein  41.21 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2075  putative lipoprotein  40.85 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2437  putative lipoprotein  37.97 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0530  hypothetical protein  36.02 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00175385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3204  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1902  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  25.44 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1834  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 389 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  27.15 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>