79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4704 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  67.72 
 
 		 470 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  67.23 
 
 		 470 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  973    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  59.66 
 
 		 498 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  56.99 
 
 		 470 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  55.96 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  42.32 
 
 		 465 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  42.76 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  42.76 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  41.47 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  42.08 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  45.45 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  43.68 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  41.21 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  43.1 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  41.59 
 
 		 484 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  40.78 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  38.29 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  42.41 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  42 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  39.74 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  38.06 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  40.09 
 
 		 462 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  37.44 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  36.36 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  39.96 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  41.47 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  36.34 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  35.41 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  35.04 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  35.84 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  35.62 
 
 		 494 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  36.19 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  37.47 
 
 		 495 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  35.57 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  36.14 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  31.03 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  26.94 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  26.44 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  26.21 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  26.21 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  26.53 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  24.6 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  25.97 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  25.91 
 
 		 444 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  28.37 
 
 		 404 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  28.31 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  24.11 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  26.18 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  28.9 
 
 		 404 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  29.87 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  25.11 
 
 		 391 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  23.27 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  25.35 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6450  hypothetical protein  38.92 
 
 		 176 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  24.83 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  26.4 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  23.7 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  27.74 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  25.11 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  25.11 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  27.36 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  26.39 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  25.42 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  23.26 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3805  hypothetical protein  38.38 
 
 		 138 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.702256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  34.48 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  38.61 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  33.04 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  35.45 
 
 		 348 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  21.51 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  24.78 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  32.71 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  48.94 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  46.81 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  25.72 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  34.44 
 
 		 364 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>