More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4095 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
318 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  75.39 
 
 
321 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  73.52 
 
 
321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0207  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 
327 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.91 
 
 
325 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2615  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
329 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00219315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0490  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
325 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.86 
 
 
332 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0464  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
325 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1926  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.2 
 
 
338 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53110  oxidoreductase  37.65 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0360  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
325 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1909  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
329 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260118  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4656  oxidoreductase  36.25 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1779  alcohol dehydrogenase  38.31 
 
 
321 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3759  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.68 
 
 
318 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.56 
 
 
325 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4742  alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
344 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3826  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.7 
 
 
311 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.0906959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.35 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  30.64 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.43 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.05 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.89 
 
 
327 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 
302 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
339 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.68 
 
 
333 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.53 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  29.85 
 
 
304 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
326 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.8 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.68 
 
 
326 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 
321 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
328 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.92 
 
 
310 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.04 
 
 
307 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.62 
 
 
338 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
324 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.14 
 
 
326 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
337 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
361 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
342 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
339 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.13 
 
 
324 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  26.97 
 
 
328 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
328 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.31 
 
 
328 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
341 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  28.18 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.97 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.21 
 
 
307 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.99 
 
 
350 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
339 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.58 
 
 
326 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
323 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
330 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  26.97 
 
 
328 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.93 
 
 
328 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.38 
 
 
335 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
308 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.33 
 
 
314 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
326 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
324 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.53 
 
 
312 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.18 
 
 
336 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  26.1 
 
 
331 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  29.22 
 
 
325 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  25.88 
 
 
331 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
324 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.65 
 
 
324 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.34 
 
 
308 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
333 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
333 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  28.18 
 
 
336 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  28.18 
 
 
336 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
328 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
322 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2864  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
301 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293163  normal  0.188893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.03 
 
 
335 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
324 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.81 
 
 
331 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.43 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.03 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
332 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.79 
 
 
315 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  29 
 
 
328 aa  99  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
343 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
329 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.83 
 
 
342 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
329 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
335 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
320 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>