More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4007 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  85.51 
 
 
292 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  83.1 
 
 
296 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  77.89 
 
 
301 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  77.82 
 
 
304 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  76.82 
 
 
304 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  77.82 
 
 
304 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  77.82 
 
 
304 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  78.29 
 
 
304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  76.66 
 
 
291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  77.11 
 
 
304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  77.62 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  77.98 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  76.62 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  77.62 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  77.62 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  77.62 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  77.98 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  77.62 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  56.23 
 
 
285 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  57.76 
 
 
277 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  54.32 
 
 
285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  54.83 
 
 
297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  56.68 
 
 
277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  58.84 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  56.73 
 
 
277 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  57.4 
 
 
277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  55.91 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  57.71 
 
 
280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  55.96 
 
 
276 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
279 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  55.64 
 
 
276 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  55.84 
 
 
279 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  55.04 
 
 
287 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  56.88 
 
 
295 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  54.51 
 
 
284 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  54.87 
 
 
276 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  55.64 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  52.35 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 
291 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  55.27 
 
 
274 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  55.27 
 
 
274 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  54.12 
 
 
279 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  55.4 
 
 
276 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  52.65 
 
 
287 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  53.05 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  50.18 
 
 
291 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 
650 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
345 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  48.48 
 
 
276 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 
329 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
332 aa  228  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  51.15 
 
 
281 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
332 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.2 
 
 
333 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.21 
 
 
347 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.11 
 
 
553 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1988  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.45 
 
 
331 aa  225  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2995  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
330 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  49.81 
 
 
286 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
340 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  46.76 
 
 
623 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 
347 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2289  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.76 
 
 
331 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.038391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.72 
 
 
336 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.72 
 
 
340 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
347 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 
347 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 
347 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 
353 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.76 
 
 
623 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  40.73 
 
 
283 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
359 aa  222  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 
353 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 
282 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0236  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
332 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3972  ABC transporter related  46.39 
 
 
282 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1858  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3825  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.39 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.39 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.39 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2192  oligopeptide transporter ATP-binding component  43.77 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0133758  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4007  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.39 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.39 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  46 
 
 
278 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
333 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.77 
 
 
357 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>