More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3665 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  61.65 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 211 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 211 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 211 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  62.5 
 
 		 211 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  62.83 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  57.62 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  61.46 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1646  carbonate dehydratase  62.83 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2257  carbonate dehydratase  62.83 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  59.38 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2174  carbonate dehydratase  62.3 
 
 		 213 aa  237  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2281  carbonate dehydratase  62.3 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.710265  normal  0.440808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2296  carbonate dehydratase  62.3 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5585  carbonate dehydratase  61.78 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691086  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1020  carbonate dehydratase  63.24 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.870434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  45.59 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  46.53 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  47.52 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  46.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  46.53 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  43.46 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  45.54 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  46.04 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  44.39 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  44.66 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  44.66 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  44.66 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  47.42 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  45.31 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  44.66 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  46.39 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  43.9 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2100  carbonate dehydratase  46.7 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.54932  normal  0.632203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  44.66 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  43.9 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  46.84 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  44.33 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  44.33 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  43.69 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  46.39 
 
 		 201 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  47.42 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  45.41 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  46.32 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  44.04 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 201 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  45.63 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  43.46 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  44.85 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  41.67 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  44.1 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  44.44 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  43.3 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  44.85 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  44.12 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  45.96 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  43.62 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  46.39 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  46.39 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  44.1 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  43.12 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  45.15 
 
 		 216 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  43.12 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  40 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  45.88 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  45.88 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  41.03 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  43.59 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  40.2 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  47.42 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  47.34 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  42.7 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  44.9 
 
 		 255 aa  161  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  45.88 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  44.85 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  44.15 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  42.29 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  42.18 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  41.75 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  43.3 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  42.52 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  48.4 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  44.21 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  44.21 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  44.44 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  42.93 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  39.25 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>