37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1246 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  72.41 
 
 
172 aa  197  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  65.91 
 
 
171 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  59.46 
 
 
178 aa  151  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  60.54 
 
 
181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  58.23 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  55.83 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  58.23 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  58.13 
 
 
183 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  54.22 
 
 
178 aa  147  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  57.25 
 
 
171 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  56.49 
 
 
171 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  56.49 
 
 
314 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  46 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  41.01 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  45.45 
 
 
125 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  45.45 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  45.63 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  35.35 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  35.42 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  29.2 
 
 
230 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  28.33 
 
 
231 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  29.56 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  32.99 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  31.07 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  29.9 
 
 
210 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  28.21 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  28.21 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  28.21 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  30.1 
 
 
183 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  25.64 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0888  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  30.07 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  28.12 
 
 
209 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>