43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2993 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2993  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948652  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  55.74 
 
 
64 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2541  hypothetical protein  55.56 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000693132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1672  hypothetical protein  55.56 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  44.07 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  47.54 
 
 
65 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5166  hypothetical protein  41.38 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000077985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3048  hypothetical protein  38.03 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810584  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3006  hypothetical protein  38.03 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863054  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  46.43 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  39.66 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  46.43 
 
 
62 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  38.6 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1358  hypothetical protein  41.43 
 
 
99 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  38.6 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  38.6 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  38.6 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  38.6 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  39.66 
 
 
526 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  35 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  38.33 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1373  hypothetical protein  39.66 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3153  hypothetical protein  39.66 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3024  hypothetical protein  39.66 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0862773  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1282  hypothetical protein  39.66 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0994  hypothetical protein  39.66 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1974  hypothetical protein  39.66 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  39.66 
 
 
399 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  38.6 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1083  hypothetical protein  35.38 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  39.29 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  39.29 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4768  hypothetical protein  37.04 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16880  hypothetical protein  39.53 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301731  normal  0.232063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  32.73 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  37.29 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1261  hypothetical protein  35.85 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388151  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  27.27 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2286  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11440  hypothetical protein  38.3 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2003  hypothetical protein  26.79 
 
 
104 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00035748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>