36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2068 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 358 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.77 
 
 		 347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.96 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  48.73 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  49.52 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  49.52 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  49.52 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.71 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.67 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  42.47 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  41.27 
 
 		 485 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.61 
 
 		 506 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  36.71 
 
 		 485 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.18 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  38.11 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.11 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.16 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.55 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  36.31 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.02 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.78 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  31.76 
 
 		 377 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  33.03 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.78 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  26.71 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  29.52 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  28.46 
 
 		 391 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  34.67 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  32.26 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  34.67 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  26.01 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  37.74 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  29.25 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  37.74 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  28.42 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>