155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1693 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.19 
 
 
270 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.5 
 
 
286 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  82.9 
 
 
270 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.27 
 
 
270 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.53 
 
 
270 aa  457  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  81.48 
 
 
270 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.02 
 
 
269 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  84.44 
 
 
258 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  51.89 
 
 
279 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  51.89 
 
 
279 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  41.73 
 
 
277 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.75 
 
 
277 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.75 
 
 
277 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.23 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 
268 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  41.06 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.15 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  40.61 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.64 
 
 
268 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.34 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.7 
 
 
298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.53 
 
 
277 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.08 
 
 
268 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.49 
 
 
277 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.95 
 
 
286 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  40.88 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  40.07 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.93 
 
 
276 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.34 
 
 
277 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.61 
 
 
273 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  37.12 
 
 
273 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  27 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  30.57 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  30.23 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  28.12 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  24.49 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  24.08 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  29.41 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  24.15 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  29.41 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  29.41 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  33.91 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  24.79 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  30.58 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  29.82 
 
 
251 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  30.58 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  27.75 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  25.88 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  27.83 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  25.21 
 
 
240 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  25.88 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  26.97 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  25.85 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_002950  PG1902  uridylate kinase  30.84 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  28.85 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  24.64 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  28.57 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  23.41 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  25.96 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  26.96 
 
 
239 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  28.49 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  26.19 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  22.73 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  27.33 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  27.59 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  30.06 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  23.11 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  26.03 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  28.7 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  27.33 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  23.31 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  28.21 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  24.12 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
390 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  29.91 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  29.13 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  26.67 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  25.3 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  25.3 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  23.36 
 
 
237 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  25.79 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  24.67 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  24.39 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  27.13 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  30 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  23.08 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  28.46 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  25.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  26.32 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  24.23 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  25.11 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  25.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  25.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  25.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  25.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  21.57 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  24.66 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  28.7 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  24.66 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>