More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0674 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
322 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  61.49 
 
 
322 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  56.17 
 
 
324 aa  351  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0875  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.76 
 
 
324 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7355  putative quinone oxidoreductase  55.17 
 
 
322 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5962  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.18 
 
 
323 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0181365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  49.69 
 
 
324 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
324 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.2 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3432  quinone oxidoreductase  49.15 
 
 
320 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
325 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.52 
 
 
327 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
324 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.21 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 
332 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.65 
 
 
323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
324 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
324 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
324 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
324 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
322 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
324 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
324 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 
332 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 
323 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
328 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  42.28 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5633  alcohol dehydrogenase  48.6 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.83 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.49 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  43.52 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3701  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.29 
 
 
332 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4667  alcohol dehydrogenase  48.29 
 
 
332 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
325 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.17 
 
 
326 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.2 
 
 
332 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
326 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.46 
 
 
328 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.37 
 
 
324 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  42.41 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  245  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
326 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  42.41 
 
 
327 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  42.41 
 
 
327 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  42.41 
 
 
327 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  42.41 
 
 
327 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  42.41 
 
 
327 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3912  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3799  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0978462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 
323 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 
330 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.46 
 
 
326 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 
323 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.83 
 
 
324 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 
324 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  41.23 
 
 
331 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
344 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
325 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 
322 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 
322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.24 
 
 
323 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.98 
 
 
324 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
331 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  42.41 
 
 
324 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
324 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
325 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 
325 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 
322 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
330 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.69 
 
 
328 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
325 aa  235  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29460  putative quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.49 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.05 
 
 
324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
324 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.62 
 
 
326 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
324 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
326 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
324 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 
325 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
323 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.81 
 
 
315 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  42.64 
 
 
328 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>