25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  745    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  36.26 
 
 		 427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  35.16 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  31.02 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  29.74 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  29.43 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  30.13 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  32.08 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  30.1 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  31.45 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  27.47 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  29.43 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  30.79 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  34.8 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  27.92 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  29.97 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  26.61 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  27.14 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  27.72 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  23.38 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  29.77 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  33.04 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  29.07 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  32.2 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>