36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  36.45 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  37.23 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  35.81 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  36.63 
 
 
223 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  34.43 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  36.51 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  40.88 
 
 
210 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  33.93 
 
 
241 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  37.97 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  36.16 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  38.19 
 
 
197 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  37.04 
 
 
218 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  36.51 
 
 
218 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  33.82 
 
 
214 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  36.51 
 
 
218 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  31.42 
 
 
212 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  34.76 
 
 
183 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  35.29 
 
 
211 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  31.58 
 
 
219 aa  101  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  36.51 
 
 
211 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  34.91 
 
 
210 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  36.09 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  33.7 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  29.74 
 
 
225 aa  92  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  34.12 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  32.66 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  32.75 
 
 
181 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  32.64 
 
 
215 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  32.81 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  35.14 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  37.8 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  38.58 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  32.67 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  35 
 
 
139 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>