68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07400  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  32.68 
 
 
205 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  31.28 
 
 
205 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  30.24 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  29.67 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  32.37 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  27.8 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  28.78 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  29.76 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  25.37 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  31.9 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  24.39 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  28.78 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  25.77 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  24.15 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  23.76 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  23.27 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  26.94 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  25.85 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  28.22 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  26.38 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  22.82 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  24.04 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  22.37 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1024  phosphate transport regulator-like  25.95 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  25.4 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  21.62 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  21.89 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  22.4 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  26.74 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  21.36 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  22.95 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  22.09 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  27.96 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  23.04 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  25.75 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  25.42 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  21.8 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  21.47 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  25.5 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  20.86 
 
 
206 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  20.86 
 
 
206 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  20.86 
 
 
206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  20.86 
 
 
206 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  18.87 
 
 
215 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  25.68 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  18.4 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  24.86 
 
 
214 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  18.52 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  22.12 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  23.23 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  23.44 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  23.81 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  22.55 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  19.42 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3186  protein of unknown function DUF47  28.12 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.640188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  21.69 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  24.54 
 
 
390 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  22.28 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  22.16 
 
 
209 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  23.84 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>